2003年10月，按照国家烟草专卖局省级烟草机构工商管理体制改革的要求云南中烟工业有限责任公司是国企吗，云南烟草分为云南中烟工业公司和云南省烟草专卖局（公司）。云南中烟工业公司于2011年1月27日改制更名为云南中烟工业有限责任公司。公司集卷烟生产销售、烟草物资配套供应、科研以及多元化经营等为一体，是目前全国卷烟产销规模最大的省级中烟公司。截至2018年底，云南中烟共有各类人员36864人，其中在岗员工21463人。

公司自成立以来，始终坚守和贯彻“做精做优品牌、做大做强企业”的发展战略，大力推进省内外卷烟工业企业战略重组，不断推动品牌发展和市场拓展，逐步走向了发展壮大。公司确立了“经营管控型”的管控模式，将职能定位为“战略管理、资源配置、经营管理、统筹协调、绩效管理”，并按照建立现代企业制度和法人治理结构的要求云南中烟工业有限责任公司是国企吗，设立了董事会、监事、经理层，构建了权责一致、决策科学、执行顺畅、监督有力的管理体制。

公司拥有卷烟产量规模位居行业前两位的红塔烟草（集团）有限责任公司和红云红河烟草（集团）有限责任公司，以及营销中心、技术中心（云南烟草科学研究院）、培训中心、云南合和（集团）股份有限公司、云南中烟物资（集团）有限责任公司、云南烟草国际有限公司、云南中烟特有职业（工种）职业技能鉴定站、云南中烟新材料科技有限公司等多家直属单位，参控股云南烟草机械有限责任公司、云南中烟再造烟叶有限责任公司等多家境内企业，并在瑞士、罗马尼亚、阿根廷、巴西、美国、缅甸、老挝、印尼、纳米比亚、伊朗、迪拜、香港、澳门等国家和地区拥有多家全资、参控股境外企业和多个境外许可生产项目。红塔烟草（集团）有限责任公司和红云红河烟草（集团）有限责任公司下辖国内10家全资卷烟生产企业、控股国内4家卷烟生产企业。